えーじです。このブログではパーマリンクを記事番号で行っていますが、今のところパーマリンクで問題が起こってはいません。
ただ、Admin画面で例えば記事を更新する際に、メモリを使い切ってエラーを出すことがあり、その後ブログにアクセスするとリダイレクトがループしてブラウザが止めてしまう、という現象が見られます。一度プラグインをはずして戻すと回復するのですが、ちょっと困ってます。

いずれにしても、今のところ自分でhtaccessをいじったり、プラグインのソースコードをいじったりといったことをしなくても正常に動作しているようです。何か分かりましたらまたこのスレッドでお知らせしますね。

えーじ様もパーマリンク設定でご使用されているようですが、エラーなどは発生しませんでしたか？
もし何らかの方法で対処されたのであれば、お手数だとは思いますが、是非ともご教示願いたいです。